目前，会计集中核算仍处于初级阶段，运作机制尚不完善，会计集中核算就其本身来讲是变革强化会计监督职能。由于这项变革仍处于初级阶段，有关制度尚不健全，监督力度尚不够到位。初级阶段的会计集中核算还主要忙于帐务处理的完善，在审核单位支出，一看票据是否合法，填写是否规范，内容是否完整，二看有单位领导和经办的签字。会计集中核算使单位经费支出的合法性和帐务处理规范化增强了，但是对不合理违规违纪的变通票据就无法控制。因为核算中心人员不能直接参与单位的财务活动，无法跟踪监督。防止会计集中核算后财务管理空心化、形式化已是当务之急，应建立一套完整的财务管理机制。加强会计集中核算后的财务管理，笔者提出以下五个方面看法：
　　
　　编制经费使用计划。编制经费使用计划，主要是明确经费支出范围和资金使用方向，建立起对可能发生的问题进行事前防范约束机制。编制经费使用计划，要根据全年经费收支预算和事业发展需要，本着“量入为出，略有结余”的原则，制定全面完整的本月经费支出计划。会计核算中心要严格执行经费使用计划，坚决维护经费使用计划的严肃性和权威性。
　　
　　加大政府采购力度。推行行政采购制度，有效地控制消费节约经费，是预防和控制治理腐败重要的约束机制。会计核算中心对凡纳入政府采购目录的大宗物品和物资报销发票，必须要附政府采购中心开具的“批准采购通知单”，对没有执行政府采购制度所购买的物资一律不予报销。

　　实行财务会签制度。实行财务会签制度可有效遏制“一支笔”滥用职权，以权谋私，独断专行的不法行为发生。财务审计“一支笔”的制度已不适应会计集中后加强会计监督的要求，不利于群众监督作用的发挥，实行财务会签制度是完善“一支笔”约束和监督机制的延伸。实行财务会签制度要求经办人、仓储负责人或物资验收人，部门负责人和财会稽核人员签字，最后由在限额内由“一支笔”审批。限额量可视单位业务量大小而定，限额以上资金实行领导人集体会签。
　　
　　加强报帐员法制教育。加强报帐员法制教育可有效避免报帐员事不关已明哲保身的思想，对违规违纪行为不抵制，不监督。有的甚至为了团体或个人的利益和单位领导串通一气，变通票据逃避监督。加强报帐员法制教育，可增强单位内互相制约，相互监督内部牵制机制。强化对报帐员法制教育使之具有强烈的法律意识和较高的执法水平，增强约束自己的思想行为和行使法律赋予的职责。报帐员不仅要委派，而且一定要定期轮岗。
　　
　　定期民主理财。实行定期民主理财可强化对干部约束和监督机制。实行民主理财最好一月度或一季度一次，通过财务公开，加大财务管理的透明度。会计核算中心要定期返回帐簿，凭证，报表给单位进行民主理财，单位民主理财人员构成要有群众性和代表，理财结果对不涉及单位财务信息秘密的要详细公布于众，民主理财小组将本期财务执行存在问题、改进意见有关情况及效果评价、分析及时反馈给会计核算中心。