2005年2月，台塑集团做了两个妥协：不再坚持以内资基金会全资投建医院，而选择与厦门市属的海沧公用事业发展有限公司合资，后者持股30%；不再坚持设立非营利医院，最终的批复为“营利医院”，厦门长庚在“两（年）免三（年）减半”的优惠政策之后，将按企业模式缴税，而厦门的公立医院都是免税的。
2008年5月6日，在申请提交七年之后，台塑集团在大陆的首家医院终于在厦门开业。接着，明基医院和旺旺医院纷纷在南京、长沙等地开业。台资医院们还是充当了“鲶鱼”的角色。张医生告诉记者，他听说了台湾旺旺医院在长沙开业时，遭遇到当地国有医院的冲击，还被威胁。“由于厦门长庚医院不是处在厦门岛内，而是处在厦门台商群聚的海沧区，所以这方面的矛盾可能少些。”
一直以来，长庚医院的盈利方式是美国的医院运行模式+台塑的效率管理。大部分台资医院实行“主诊医师全责制”，这是台资医院力推的全新医疗服务模式。它要求每位病患入院后均由一名主诊医师全程负责，与此相对应的，还有“主护护理制”、“门诊跟诊制”等，患者在医院中的各项服务均有专人跟踪。这样做最大的好处是患者信任医生、信任医院，给医院本身带来品牌效应。
文玉民并不认为长庚有什么深奥的盈利方式。作为一家平民医院，长庚医院的治疗费用与国有医院相当。但是床位费略高，文玉民介绍，常规的三人房间每人每天为86元人民币，国有医院是50元左右。但是，长庚医院有很多体贴平民患者的细节。比如说，尿检和洗手间只有两步之遥。经历过在国有医院里端着尿检杯、走长长的走廊的尴尬的病患，就会知道长庚医院带来的是什么了。
据介绍，台湾长庚医院在成立3年后就开始盈利，一年净赚60亿元人民币，利润率超过15%。现在可以容纳7000张病床，成为台湾最大的医疗机构。
张医生并没有说他的薪水。根据其它台资医院透露的价码，如果一名内地医生月薪3000元人民币、灰色收入大概达到15000元人民币，台资医院通常会给这名医生月薪21000元人民币。
“薪水是我考虑的原因之一。但是还有更重要的。”张医生说，“在长庚我能够积累到许多经验，同样的资历在国有医院可能要多花费我5年的时间。比如说，通过网络我可以看到过去20多年所有长庚医院关于骨科的所有诊断结果，所有内容对我都是公开的。再有，遇到疑难杂症，我无法确定的，通过桌子上的电话10分钟我可以邀请到长庚医院这方面的权威——可能在台湾，和我一起会诊。这在平顶山医院是不可想象的。”
海基协会原副秘书长李庆平对《中国企业家》说，如果大陆每一个重要的城市都有一个台资医院，这会带来不得了的效应，将带动大陆整个医疗体系的转变。
他说，长庚们在台湾兴起的20多年，是台湾社会向福利型社会转型的进程。“可以说，台湾医疗产业的革命，是台湾的第二次工业革命。台湾有21个县市，你在任何县市、任何医院都可以看病，看病就医只交台币150元挂号费，而药费、手术费都不要钱。”李庆平说，“长庚医院是王氏家族倾注了许多管理理念的济世产业。大陆跟台湾来往，要学台湾这些地方，坏的不要学，尤其是台湾阻碍进步的乱七八糟的政治不要学。”
