之后，微软将收购价格提高到475美元，每股33美元，而固执的杨致远仍然发表强硬声明，指责微软严重低估了雅虎市值，是对雅虎全体员工的一种蔑视。无奈，微软于5月4日撤回收购提议，宣布放弃整体收购雅虎。6月13日，双方所有谈判全部终止。
对于杨致远来说，他的这种坚持让自己和雅虎都付出了沉重代价。雅虎和微软谈判失败之后，雅虎股价一路狂跌。从起初的19美元跌一度跌穿过10美元，市值已不足180亿美元。可是仅仅两年前，雅虎的市值还高达1000多亿美元！跌幅之大创下了历史记录。《新闻周刊》网站评论就此毫不客气地指出：“不管过去发生了什么，雅虎放弃微软收购可能是科技史上最为愚蠢的举动之一。”
为了安抚愤怒的股东，杨致远转而寻求与竞争对手谷歌在搜索广告市场开展合作，而这显然是杨致远犯下的第二个错误。虽然该合作短期内能够提高雅虎收入，避免重组。但如果这样合作，雅虎在美国的搜索结果旁边将出现谷歌提供的广告，而谷歌已经在搜索广告领域占据了主导地位，如此看来，雅虎同谷歌合作其实是“与敌为友”，导致的结果只能是使谷歌变得更为强大。
最终，双方的合作因为被认为是触发了美国司法部的反垄断程序而不得不停止。面对业界的强烈反对和反垄断诉讼的压力，谷歌主动宣布放弃与雅虎之间的搜索广告交易。这给和微软联姻未果的雅虎以巨大的打击。内忧外患之下，公司的核心团队也开始不稳定，据统计，从杨致远接任公司CEO以来，共有114名高管离开了雅虎，其中有一部分人跳槽到竞争对手谷歌。
此时，落寞的杨致远终于吐露心声：“我相信，微软当前应该做的事情就是收购雅虎。我认为这是一个好主意，只要价格合适，不管是什么价格，我们现在都愿意出售公司。”
只可惜，落花有意，流水无情，微软已经失去了曾经的兴趣。
兜兜转转回到起点，当初30多美元的股价，已经变成不到10美元。雅虎的股东们眼看着就要到手的钱被杨致远折腾得打了水漂，自然不能容忍。去年的8月7日，雅虎公布了修正之后的董事会投票结果：董事局中只有66.3％的人支持杨致远，远低于之前预计的85%支持率，而投票的反对率较之前翻了一番。
流年不利
当然，把所有责任都归咎于杨致远一个人身上是不公平的。对雅虎而言，正面临着两种状况：一是不能有效地创新，而实际上杨致远已经给雅虎开出了“药方”，只不过不是“特效的西药”，而是需要“慢治的中药”。可是雅虎的董事会却不想再等了，这使杨致远没有充裕的时间来进行彻底有效的变革、创新；另一种局面是雅虎正面临着周期性衰退。去年由美国金融危机引发的全球经济下滑，使广告商大幅度地削减公司广告营销费用，作为网络品牌广告最大供应商的雅虎自然首先深受其害，遭遇了比其他企业更为严重的损失。而相反，在金融危机下针对性更强的文本搜索广告业务却呈现出新的一番增长之势。如此一来，以文本搜索广告为主的对手谷歌占尽优势，这就进一步限制了杨致远扭转公司业绩的计划。
根据腾讯网对杨致远的辞职事件所做的网上随机调查显示，认为杨致远下课的原因，最主要是受到金融危机的影响的，占总比例的40%，其次是拒绝微软收购和谷歌广告合作计划失败，其分别占总比例的39%和17%。
